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Puntos clave
- Una factura rectificativa corrige errores sin borrar la original: usa códigos R1-R5 según el motivo
- Bajo Verifactu no puedes eliminar ni modificar facturas emitidas; la sanción por manipular el sistema es €50.000
- Los errores más comunes son: borrar la original, no referenciarla, usar la misma numeración o emitir fuera de plazo
- El 80% de las rectificativas se evitan con validación de datos antes de emitir y vista previa obligatoria
Aviso legal: Esta guía tiene carácter informativo y no constituye asesoramiento fiscal profesional. La normativa tributaria está sujeta a cambios. Para decisiones específicas sobre tu caso, consulta siempre con un asesor fiscal colegiado. Información actualizada a enero de 2026.
Son las 9 de la noche. Acabas de darte cuenta de que la factura que enviaste esta mañana tiene mal el importe: pusiste 1.210€ en lugar de 121€. Tu primer instinto es abrir el programa, borrar esa factura, y hacer una nueva.
No lo hagas.
Ese simple acto de borrar una factura emitida puede costarte hasta 50.000€ de multa según el artículo 201 bis de la Ley General Tributaria. Y con Verifactu ya en vigor, Hacienda detecta automáticamente cualquier salto en la numeración o registro eliminado. Lo que antes era un error administrativo, ahora puede interpretarse como fraude fiscal.
La buena noticia es que existe una solución legal, sencilla y segura: la factura rectificativa. En este artículo te explico exactamente qué es, cuándo necesitas una, cómo emitirla correctamente según los nuevos requisitos de Verifactu, y algo todavía más valioso: cómo evitar tener que hacerla en primer lugar.
Qué es una factura rectificativa (y qué NO es)
Una factura rectificativa es un documento fiscal que corrige o modifica una factura anterior ya emitida. No la sustituye ni la borra, sino que la complementa, dejando constancia legal de que hubo un error y de cómo se ha corregido. Está regulada en el artículo 15 del Real Decreto 1619/2012 sobre obligaciones de facturación, y desde 2026 tiene implicaciones adicionales bajo el sistema Verifactu.
Piensa en tu sistema de facturación como un libro de cuentas encadenado. Cada factura que emites es una página numerada que queda permanentemente registrada. Si escribiste algo mal en la página 42, no puedes arrancarla y escribir una nueva con el mismo número. Lo que haces es añadir una nueva página (la 43) que dice: "Corrección de la página 42: donde decía X, ahora dice Y". Ambas páginas permanecen en el libro, y cualquiera que lo revise puede ver exactamente qué pasó y cómo se solucionó.
Esto es exactamente lo que hace una factura rectificativa: crea un registro adicional que referencia la factura original, explica el error, y proporciona los datos correctos. La factura original sigue existiendo, pero queda vinculada a su corrección. Para Hacienda, esta trazabilidad completa es fundamental porque demuestra que no estás intentando ocultar operaciones o manipular importes.
Cuándo necesitas emitir una factura rectificativa
No todos los errores requieren una rectificativa. Pero cuando la necesitas, es obligatoria. Aquí tienes los casos principales en los que debes emitir una según la normativa española vigente:
Errores en datos fiscales básicos: Si pusiste mal el NIF de tu cliente, su razón social completa, tu propio NIF, o la fecha de emisión de forma incorrecta, debes rectificar. Estos datos son críticos porque Hacienda los usa para cruzar información entre proveedores y clientes. Un NIF erróneo puede hacer que tu cliente no pueda deducirse el IVA de tu factura, y eso te mete en un problema serio con él.
Errores en importes: Este es el más frecuente y el que más preocupa. Si te equivocaste en la base imponible, el porcentaje de IVA aplicado (21% en lugar de 10%), la cuota de IVA resultante, las retenciones de IRPF, o el total final, necesitas rectificar inmediatamente. La diferencia entre lo que cobraste y lo que declaras a Hacienda debe cuadrar perfectamente, y cualquier desajuste activa alertas en el sistema de la AEAT. Consulta nuestra guía sobre el Modelo 303 vs Modelo 130 para entender cómo afecta esto a tus declaraciones trimestrales.
Descuentos o bonificaciones posteriores: Imaginemos que emites una factura de 1.000€ el día 5, pero el día 10 llegas a un acuerdo con tu cliente para aplicarle un descuento del 20% por volumen o por pronto pago. No puedes simplemente acordarlo de palabra o ajustarlo en la siguiente factura. Debes emitir una rectificativa que modifique la base imponible de esa factura específica según el artículo 80 de la Ley del IVA.
Devoluciones de productos o servicios: Si tu cliente devuelve la mercancía o cancela el servicio después de que ya emitiste y enviaste la factura, esa operación ya no se va a realizar. Debes emitir una rectificativa que anule total o parcialmente el importe facturado. No vale con devolverle el dinero sin más, porque fiscalmente seguirías obligado a declarar ese ingreso que en realidad no se produjo.
Impagos confirmados: Si un cliente no te paga después de 6 meses (o 1 año si es una gran empresa), puedes emitir una factura rectificativa para recuperar el IVA que ya ingresaste a Hacienda. Esto está regulado en el artículo 80.Cuatro de la Ley del IVA, y requiere que hayas reclamado judicialmente o notarialmente el cobro. Consulta nuestra guía sobre cobrar facturas impagadas para más detalles sobre este proceso.
Los códigos R1 a R5: qué significan y cuándo usar cada uno
Con Verifactu, todas las facturas rectificativas deben identificarse con un código específico que indica el motivo de la rectificación. Esto es obligatorio desde enero 2026 para sociedades y desde julio 2026 para autónomos. Aquí te explico cada código:
R1 - Errores fundados en derecho: Este es el código más común y el que vas a usar el 80% de las veces. Se aplica cuando hay un error material en la factura original o cuando se produce una modificación de la base imponible por las causas principales del artículo 80 de la Ley del IVA. Úsalo cuando te equivocaste en el importe, pusiste mal el IVA, aplicaste un tipo impositivo incorrecto, olvidaste incluir un concepto, pusiste datos fiscales erróneos, o calculaste mal un descuento. También se usa cuando aplicas descuentos posteriores acordados o cuando devuelven envases.
R2 - Concurso de acreedores: Este código se usa cuando tu cliente entra en concurso de acreedores (quiebra, suspensión de pagos, administración concursal). Puedes emitir una rectificativa R2 para modificar la base imponible de las facturas impagadas dentro de ese proceso y recuperar el IVA correspondiente según el convenio concursal.
R3 - Créditos incobrables: Este es el código para recuperar el IVA de facturas que no te han pagado después de intentar cobrarlas por la vía legal. Requiere que hayan pasado al menos 6 meses desde que emitiste la factura (1 año para grandes empresas), hayas reclamado el cobro de forma fehaciente (requerimiento notarial o reclamación judicial), y cumplas todos los requisitos del artículo 80.Cuatro de la Ley del IVA.
R4 - Otras causas: R4 es el código "cajón de sastre" para todas las rectificaciones que no encajan en R1, R2 o R3. Úsalo para errores en datos no monetarios que no afectan a la base imponible pero que deben corregirse (descripción errónea, dirección incorrecta), correcciones administrativas que te requiere Hacienda, o cualquier situación que requiera rectificativa pero no tenga código específico.
R5 - Rectificativa de factura simplificada: Si la factura original era una factura simplificada (ticket), su rectificativa siempre será R5, independientemente del motivo. Esta es una regla fija: factura original simplificada = código R5.
Además del código de tipo (R1-R5), debes indicar si la rectificación es por sustitución (clave "S", reemplaza completamente los datos de la original) o por diferencias (clave "I", solo indica el ajuste a aplicar).
Cómo emitir una factura rectificativa paso a paso
Paso 1: Identifica el error lo antes posible. La normativa dice que debes emitir la rectificativa "tan pronto como tengas conocimiento del error". Cuanto más tiempo pase, más complicaciones pueden surgir, especialmente si tu cliente ya ha contabilizado tu factura y cerrado su trimestre fiscal.
Paso 2: Comunica el error a tu cliente. No emitas la rectificativa sin avisar. Llama a tu cliente, explícale qué pasó, y envíale un email formal describiendo el error y cómo lo vas a solucionar. Si hay un ajuste económico, acláradlo antes de emitir el documento.
Paso 3: Decide el tipo de rectificación. La rectificativa por sustitución anula completamente la factura original y emite una nueva con todos los datos correctos. La rectificativa por diferencias solo indica el ajuste sobre la original. Usa sustitución cuando el error afecta a múltiples campos; usa diferencias cuando solo hay un error puntual de importe.
Paso 4: Numera correctamente la rectificativa. La factura rectificativa debe tener su propia numeración, separada de la serie ordinaria. Muchos sistemas usan una serie específica (por ejemplo, "R-2026-001"). Lo importante es que sea única y correlativa.
Paso 5: Incluye todos los campos obligatorios. Una rectificativa debe llevar: número y serie específica, la palabra "Factura rectificativa" claramente visible, tus datos completos, datos del cliente, referencia exacta a la factura original (número, serie y fecha), descripción clara del motivo, el código R correspondiente, si es por sustitución (S) o por diferencias (I), y los importes correctos.
Paso 6: Emite y envía. Si usas software conforme a Verifactu, el sistema generará automáticamente el registro con el hash encadenado y el QR. La rectificativa debe remitirse antes del día 16 del mes siguiente a su expedición.
Paso 7: Ajusta tu contabilidad. Registra la rectificativa en tus libros de IVA y declárala en tu próximo Modelo 303. Guarda ambas facturas durante al menos 4 años.
Errores comunes que debes evitar
Error fatal #1: Borrar la factura original y hacer una nueva. Esto rompe la numeración correlativa, Verifactu lo detecta automáticamente, y puede interpretarse como fraude fiscal. La sanción por usar un sistema no conforme es de 50.000€ fijos según el artículo 201 bis de la LGT. Este es uno de los errores más costosos que cometen los autónomos principiantes.
Error #2: Emitir una nueva factura sin referenciar la original. Si no referencias explícitamente la factura que estás corrigiendo, ahora tienes DOS facturas válidas en el sistema. Tu cliente puede deducirse el IVA de ambas, y Hacienda te reclamará por duplicidad.
Error #3: Usar el mismo número de la factura original. La rectificativa debe tener su propio número único dentro de su serie. No puedes reutilizar el número de la original.
Error #4: No explicar el motivo claramente. Poner "Error en factura" no es suficiente. Escribe algo específico: "Rectifica la base imponible de la factura 2026-042 de 1.000€ a 500€ por error en la cantidad de unidades facturadas".
Error #5: Emitir fuera de plazo. La normativa establece que debes emitir la rectificativa "tan pronto como" detectes el error. Si pasan meses sin justificación, Hacienda puede cuestionar tus motivaciones.
Cómo prevenir tener que hacer rectificativas
Aquí está lo realmente valioso: el 80% de las facturas rectificativas se podrían haber evitado con simples validaciones antes de emitir. En Invoo hemos analizado los patrones de errores más frecuentes y diseñado sistemas específicos para prevenirlos:
Validación de datos en tiempo real: Un buen software no te deja continuar si falta algún campo obligatorio o si hay incoherencias obvias. Si el total no cuadra con base + IVA, el sistema te avisa antes de emitir. Si el NIF tiene formato incorrecto, te lo señala. Esto elimina errores tontos antes de que se conviertan en problemas.
Vista previa obligatoria antes de enviar: Esos 15 segundos revisando cómo va a quedar la factura eliminan el 90% de errores de transcripción. Es una barrera simple pero extraordinariamente efectiva.
Gestión de series automática: Los problemas de numeración (saltos, duplicados, series mezcladas) desaparecen cuando el sistema asigna automáticamente la serie y el número correlativo según reglas predefinidas. Tú solo creas la factura; el sistema decide la numeración correcta.
Integración con Verifactu desde el diseño: Los sistemas que añadieron Verifactu como un parche tienen más probabilidad de generar errores. Las soluciones diseñadas con Verifactu integrado desde el principio gestionan automáticamente el hash, el encadenamiento, el QR y los códigos de rectificativas sin que tengas que pensar en ello.
La realidad es que con un sistema bien configurado, deberías emitir menos de una rectificativa por cada 100 facturas. Y cuando tengas que hacerla, el proceso debería ser guiado, con el software preguntándote el motivo, seleccionando el código R correcto, y validando que todo esté correcto antes de emitir.
Conclusión
Emitir facturas rectificativas no es complicado si conoces las reglas. Pero equivocarte en el proceso puede costarte desde multas de 150€ por factura hasta los 50.000€ por manipular el sistema de facturación. Y con Verifactu, los errores son mucho más visibles para Hacienda.
Recuerda las claves: nunca borres ni modifiques una factura emitida, identifica el código R correcto según el motivo, referencia siempre la factura original, explica claramente qué rectificas y por qué, y comunica al cliente antes de emitir. Pero más importante aún: invierte en prevención. Un sistema que valida datos antes de emitir, que te muestra una preview clara, y que está diseñado con Verifactu integrado eliminará la mayoría de rectificativas antes de que sean necesarias.
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Fuentes y metodología
Normativa oficial consultada:
- Agencia Tributaria - Facturas rectificativas
- Manual IVA 2024 - Facturas de rectificación
- Real Decreto 1619/2012 - Obligaciones de facturación
- FAQ Verifactu - Procedimientos de facturación
Última actualización: Enero 2026